СВЯЗЬ РЕЗУЛЬТАТОВ MALDI-TOF-МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ С КУЛЬТУРАЛЬНЫМИ СВОЙСТВАМИ ASPERGILLUS FUMIGATUS (RELATIONSHIP OF RESULTS OBTAINED BY MALDI-TOF-MASS-SPECTROMETRY WITH CULTURAL PROPERTIES OF ASPERGILLUS FUMIGATUS)

Рябинин И.А., Чилина Г.А.
Ryabinin I.A., Chilina G.A.

Author address: 

НИИ медицинской микологии им. П.Н. Кашкина, Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург, Россия
Kashkin Research Institute of Medical Mycology of North-West State Medical University named after I.I. Mechnikov, St. Petersburg, Russia

Abstract: 

Цель работы - установить связь культуральных свойств Aspergillus fumigatus и распределения белковых масс-спектро-профилей, полученных методом MALDI-TOF-масс-спектрометрии.

Материалы и методы. В работе использовали 30 штаммов A. fumigatus, выделенных из клинического материала. Штаммы суб-культивировали на картофельно-глюкозном агаре, затем инокулюм спор засевали трехточечным методом на агар Чапека с дрожжевым экстрактом (ЧДЭ) и на бульон Сабуро, разлитый в пробирки эппендорф по 0,5 мл. Посевы инкубировали при 37 ° С, чашки с ЧДЭ - 4 суток, бульон Сабуро - 1 сутки. По завершению оценивали характер роста на ЧДЭ и проводили фотосъемку, а из бульонной культуры делали экстракцию белков и осуществляли MALDI-TOF-масс-спектрометрию белкового профиля на приборе Autoflex speed TOF/TOF. Из совокупности полученных белковых масс-спектро-профилей образовали трехмерный кластер анализа главных компонент для выяснения пространственного распределения профилей с целью последующей группировки.

Результаты. По особенностям морфологии колоний и пространственной близости масс-спектро-профилей в кластере удалось разделить 25 изученных штаммов на 5 групп. Группы отличались следующими характеристиками колоний: I - хорошо выражена центральная зона, яркая пигментация и ободок белого мицелия по периферии, занимающий не более 1/5 площади; I - очень слабая пигментация; III - центральная зона крупная с глубокой циркуляр-ной бороздой, пигментация неравномерная; IV - пигментация интенсивная, рельеф равномерно-бархатистый; V - центральная зона более темная, периферия колонии окрашена умеренно, ободок белого мицелия распространяется до % диаметра.

Заключение. Искомую связь двух упомянутых характеристик удалось установить, хотя ее достоверность трудно оценить статистически. Тот факт, что выделяемый из культуры экстракт содержит, главным образом, рибосомальные белки, которые определяют синтетическую функцию клетки, объясняет найденную связь теоретически.
 

2014

Full conference title: 

RUSSIAN-CHINESE SCIENTIFIC-PRACTICAL CONFERENCE ON MEDICAL MICROBIOLOGY AND CLINICAL MYCOLOGY (XVII KASHKIN READING)
    • All Russian CMMCM XVII