ДЕТЕКЦИЯ И ИДЕНТИФИКАЦИЯ ASPERGILLUS SPP. И ZYGOMYCETES SPP. В КЛИНИЧЕСКИХ ОБРАЗЦАХ С ПОМОЩЬЮ НОВОЙ МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ (DETECTION AND IDENTIFICATION OF ASPERGILLUS SPP. AND ZYGOMYCETES SPP. IN HUMAN BIOSAMPLES WITH NEW MULTIPLEX REAL T)

Белоцерковская Е.В., Богомолова Т.С., Авдеенко Ю.Л., Полищук А.Г.
Belotcerkovskaya E.V., Bogomolova T.S., Avdeenko Y.L., Polischouk A.G.

Author address: 

НИИ медицинской микологии им. П.Н. Кашкина Северо-Западного государственного медицинского университета им. И.И. Мечникова, Санкт-Петербург, Россия
Kashkin Research Institute of Medical Mycology of North-Western State Medical University named after I.I. Mechnikov, St. Petersburg, Russia

Abstract: 

DETECTION AND IDENTIFICATION OF ASPERGILLUS SPP. AND ZYGOMYCETES SPP. IN HUMAN BIOSAMPLES WITH NEW MULTIPLEX REAL TIME PCR.

В лаборатории молекулярно-генетической микробиологии НИИ медицинской микологии им. П.Н. Кашкина разработана новая ПЦР-система в реальном времени с плавлением продуктов амплификации высокого разрешения, позволяющая выявлять и идентифицировать аспергиллы и зигомицеты.

Цель работы заключалась в апробации новой мультиплексной ПЦР системы на клинических образцах.

Материалы и методы. Представленная ПЦР-система была протестирована на образцах биопсии, промывных вод бронхов и тканей, фиксированных в формалине и заключенных в парафин, полученных от пациентов с микотической инфекцией. Все клинические образцы были также проанализированы c помощью традиционных (микроскопия, посев, гистология) и молекулярно-генетических методов (ДНК-сиквенирование, ПЦР в реальном времени для детекции аспергиллов на основе технологии TaqMan).

Результаты, полученные с использованием ПЦР теста на образцах промывных вод бронхов, в 9 случаях полностью согласовывались и в 4 случаях - не согласовывались с данными микроскопии и посева. Для образцов биопсии установлено 7 случаев совпадения и 2 случая - несовпадения данных ПЦР теста и традиционных методов. В большинстве случаев (4 из 5) результаты ПЦР-системы, полученные на образцах тканей, заключенных в парафин, согласовывались с данными микробиологического исследования.

Заключение. Согласно проведенному исследованию, результаты ПЦР-теста и традиционных методов согласуются в 75% случаев.
 

2014

Full conference title: 

RUSSIAN-CHINESE SCIENTIFIC-PRACTICAL CONFERENCE ON MEDICAL MICROBIOLOGY AND CLINICAL MYCOLOGY (XVII KASHKIN READING)
    • All Russian CMMCM XVII