ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ МИКРОСКОПИЧЕСКИХ ГРИБОВ В УРОГЕНИТАЛЬНОМ ТРАКТЕ ЖЕНЩИН (GENETIC DIVERSITY OF MICROSCOPIC FuNGI IN THE UROGENITAL TRACT OF WOMEN)

Фоменко Н.В.1, Иванов М.К.1,2
Fomenko N.V.1, Ivanov M.K.1,2

Author address: 

1ЗАО «Вектор-Бест»; 2Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск,Россия
1JSC «Vector-Best»; 2Institute of Cytology and Genetics Novosibirsk SB RAS, Novosibirsk, Russia

Abstract: 

Доминирующую роль в этиологии грибковых инфекций урогенитального тракта играют Candida spp. Согласно данным, полученным зарубежными авторами, наиболее распространенными возбудителями кандидозов считают C. albicans, C. parapsilosis, C. glabrata, C. tropicalis и C. krusei, однако встречаемость разных видов варьирует в зависимости от страны и метода исследования.

Цель работы - анализ генетического разнообразия микроскопических грибов в образцах случайной выборки соскобов урогенитального тракта женщин Москвы и Новосибирска при помощи ПЦР и сиквенирования.

Материалы и методы. Проанализировали 1269 женских урогенитальных соскобов, предоставленных отделениями лаборатории «ИНВИТРО» г. Москва и Новосибирск и АНО ЦНМТ г. Новосибирска. Выявление ДНК микроскопических грибов без определения вида и ДНК C. albicans проводили с использованием тест-системы на основе ПЦР с детекцией в реальном времени «РеалБест C. albicans/Fungi» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск). ДНК микроскопических грибов выявили в 42,1% образцов в количестве 104-107 копий на соскоб. Видовую принадлежность грибов устанавливали при помощи сиквенирования вариабельных фрагментов генов 18S рРНК, 28S рРНК и 5S рРНК-Ш2.

Результаты. В 72% грибы были представлены родом Candida. Помимо этого, обнаружили Aspergillus spp., Cryp-tococcus spp., Trichosporon spp., а также не классифицированные грибы. В 40 случаях видовую принадлежность не установили из-за присутствия двух и более видов в одной пробе. В результате анализа исследованных локусов ДНК Candida spp. получили дендрограммы сходной топологии. Помимо C. albicans, определенной в 15,4% случаев, выявили ДНК еще у 12 видов рода Candida. Следующими после C. albicans по частоте встречаемости оказались C. palmio-leophila (18,6%) и C. guilliermondii (6,6%). Суммарная встречаемость C. parapsilosis, C. glabrata, C. tropicalis и C. krusei составила 5,4%. Также обнаружили C. pelliculosa, C. famata, C.    lusitaniae, C. sojae, C. zeylanoides и C. lactis-condensi (в сумме 10,8%).

Заключение. Полученные результаты практически совпадают для проб, полученных из Москвы и Новосибирска, однако они отличаются от приводимых в литературе.

2013

Full conference title: 

RUSSIAN-CHINESE SCIENTIFIC-PRACTICAL CONFERENCE ON MEDICAL MICROBIOLOGY AND CLINICAL MYCOLOGY (XVI KASHKIN READING)
    • All Russian CMMCM XVI